因为水垢的导热性很差，仅为铜、铁等金属的十分之一到数百分之一，如果电热水器的加热棒上附着了大量的水垢，就会极大的影响加热效率。据专业试验表明：当水垢的厚度为1.5mm时，电热水器就要多消耗6%的电能；水垢厚达5mm时，会多耗能15%；而水垢厚度为8mm时，增加的电能消耗则增至34%。

水垢中含有多种化学成分，长期的沉淀和积累使水中的有害物质不断增加，可能导致皮肤过敏；粘泥、微生物、细菌在长时间不断更新，形成很多污染物质。这些脏东西能引发多种皮肤病的发生，使得抵抗力低下的儿童或者妇女洗完澡后有时感到皮肤瘙痒和起红点。

水垢吸附在热水器受热面上，特别是管内，很难清除。为了除垢需要经常清洗，因而增加检修费用，不仅耗费人力、物力、财力，而且由于经常采用机械方法与化学方法除垢，会使受热面受到损伤，大大缩短热水器的使用年限。

热水器内产生水垢后，由于传热不好，使蒸发量降低，会减少设备的压力。若水管内结垢，流通截面积减少，增加了水循环的流动阻力，严重时会将管路完全堵塞，破坏水循环，严重时会造成爆管事故。

热水器的加热棒在正常运行时，受热后很快将热量传递给水或其他介质，两者温差很大。而包裹了水垢的加热棒的热量由于受到水垢的阻挡，很难传递给水，因而温度会急剧升高，强度显著下降。热水器久而久之就会造成损坏，甚至漏电，很不安全。